|
عنوان
|
شناسایی نشانههای انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون )JD )در نژادهای بز
|
|
نوع پژوهش
|
مقاله چاپشده در مجلات علمی
|
|
کلیدواژهها
|
آماره تتا، بیماری یون، سیستم ایمنی، سیگنالهای انتخاب
|
|
چکیده
|
چکیده پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون )JD )یکی از بیماریهای مهم مزمن التهاب رودهای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر شناسایی نشانههای انتخاب با استفاده از آماره ناِاُریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا میباشد. به این منظور مجموع 331 حیوان برای 53335 جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه- هایBeadChip SNP50 Caprine تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت دادههای اولیه در نهایت 51112 نشانگر SNP و 323 رأس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده براساس آزمون آنتیبادی سرم خون )اآلیزا( در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم )132 )و بیمار )133 )گروهبندی شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزشهای تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزومهای 1 ،5 ،7( دو منطقه(، 1 ،9( دو منطقه(، 11 ،13 ،17 ،11 و 22 )دو منطقه( شناسایی شدند. همچنین در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزومهای 3 ،5( دو منطقه(، 12 ،12 ،13، 17 ،11 ،23 ،23 و 29 باالتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای IL4 ،IL13 ،TLR2 ،TLR4 ،IFNGR1 ،PGLYRP1 ،CHI3L2 ، PPFIBP1 و DENND5B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژنهای موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطالعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه ژنهای مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد. واژههای کلیدی: آماره تتا، بیماری یون، سیستم ایمنی، سیگنالهای انتخاب
|
|
پژوهشگران
|
محمد شمس الهی (نفر اول)، حسین محمدی (نفر دوم)
|