عنوان	شناسایی ریختی و مولکولی گونه‌های Alternaria و شبه Alternaria جدا شده از برخی گیاهان در استان ایلام
نوع پژوهش	پایان نامه
کلیدواژه‌ها	بلاست، تبارشناسی، دماتیاسه، گونه جدید
چکیده	جنس Alternaria یک قارچ همه‌جازی است که شامل گونه‌های ساپروفیت، اندوفیت و بیماری‌زا می‌باشد. گونه‌های بیماری-زای این جنس به بیش از 4000 گیاه میزبان آسیب می‌رسانند و در سراسر جهان پراکنده هستند. جنس Alternaria اولین بار در سال 1816 توسط Nees با گونه تیپیک Alternaria tenuis توصیف شد. در حال حاضر جنس Alternaria بر اساس تجزیه و تحلیل تبارزایی چند ژنی و با استفاده از ترکیب نشانگرهای ژنی مختلف مانند فاصله رونویسی داخلی (ITS)، ژن‌های کدکننده پروتئین مانند گلیسر آلدهید-3-‌فسفات دهیدروژناز (GAPDH)، ATpase غشای پلاسمایی، دومین زیر واحد بزرگ RNA پلیمراز (RPB2) و فاکتور افزایش طول ترجمه (TEF)، طبقه‌بندی شده است و شامل بیش از 380 گونه می‌باشد که در 29 بخش و هفت دودمان یکنواخت توزیع شده‌اند که بخش Porri بزرگترین بخش و شامل اکثر گونه‌های Alternaria با اسپور بزرگ است. گونه‌های مختلف این جنس قارچی در طبیعت می‌توانند در محیط‌های کم‌مغذی باقی بمانند و در محیط‌های غذایی ضعیف چرخه زندگی خود را کامل کنند. گونه‌های Alternaria بیشتر به‌صورت غیرجنسی دیده می‌شوند و فرم جنسی آن‌ها کمتر تشکیل می‌شود. به‌همین دلیل، تاکسونومی و شناسایی این قارچ‌ها بر مبنای فرم غیرجنسی آن‌ها پایه‌ریزی شده است. در این پژوهش 43 جدایه قارچ جنس Alternaria که به صورت اندوفیت از بافت‌های سالم کلزا و سبزیجات جدا شده بودند از کلکسیون قارچ‌های زنده دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام دریافت شد. سپس گروه-بندی جدایه-ها بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی به کمک کلیدهای شناسایی معتبر و مقایسه باندهای حاصل از نشانگر ISSR (آغازگر GTG5) انجام شد و جدایه‌ها در نه گروه قرار گرفتند. از هر گروه یک جدایه جهت بررسی‌های تبارزایی انتخاب‌ شد. جهت تکثیر و توالی‌یابی جدایه‌ها، بخش‌هایی از ژن GAPDH تکثیر گردید. بررسی ارتباط تبارزایی میان جدایه‌ها و مقایسه آن‌ها با گونه‌های مرجع موجود در بانک ژن NCBI به کمک نرم‌افزار Mega11 و بر اساس الگوریتم درست‌نمایی‌بیشینه‌انجام‌پذیرفت.‌در‌نهایت‌گونه‌های‌شناسایی‌شده‌شامل‌پنج‌جدایه‌گونهAlternaria atra‌‌‌ و یک‌جدایه گونه‌-Alternaria‌ sp. در‌بخش Ulocladioides وسه جدایه گونه Alternaria alstroemeriaeکه در بخش Alternaria و کمپلکس A.alstroemeriae قرارگرفتند.
پژوهشگران	خدیجه عباسی (استاد راهنما)، عبدالله جعفرزاده (استاد راهنما)، پریسا کرمی (دانشجو)