در این مطالعه به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی 34 ژنوتیپ زراعی و وحشی جو به همراه رقم حساس افضل از لحاظ حساسیت و مقاومت به بیماری سفیدک پودری در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در مقایسه با شاهد در گلخانه دانشگاه ایلام کشت گردید و مایه زنی با قارچ عامل بیماری در مرحله تورم سنبله صورت گرفت. با استفاده از 16 آغازگر ISSR و 6 آغازگر RAPD به ترتیب 125 و 32 باند تشکیل شد که در مجموع 27/99 و %100 باندها از چندشکلی برخوردار بودند.میانگین هتروژنی مورد انتظار، مشاهده شده و همچنین میانگین شاخص شانون در نشانگرهای ISSR (32/0، 25/0 و 35/0) و RAPD (28/0، 31/0 و 42/0) به ترتیب محاسبه شد. تجزیه خوشهای به روش UPGMA، 34 ژنوتیپ مورد مطالعه را در 5 گروه قرار داد که به ترتیب گروههای 1 و 2 ژنوتیپهای مقاوم ونیمهمقاوم، گروه 3 ژنوتیپهای حساس، گروه 4 و 5 ژنوتیپهای نیمهحساس تا حساس را شامل شدند.