هدف: پژوهش حاضر با هدف آسیب شناسی پژوهشهای دانشگاهی در حوزه های علوم انسانی و الهیات و معارف اسلامی انجام شد. روش: بر اساس هدف پژوهش، کاربردی و شیوه گردآوری داده ها، آمیختۀ تشریحی بود. جامعۀ آماری، تمامی دانشجویان سال آخر تحصیلات تکمیلی و اساتید راهنما بودند. حجم نمونه برای دانشجویان، 105 نفر به شیوه تصادفی طبقه ای و برای اساتید، 39 نفر به شیوه هدفمند بود. داده ها با پرسشنامۀ 31 گویه ای محقق ساخته و 0 برای اساتید، جمع آوری شدند. در مرحلۀ مصاحبه های هدایت شده، / 0 برای دانشجویان و 79 / ضریب پایایی 87 0 محاسبه شد. یافت هها: دانشجویان و اساتید راهنما بیشترین آسیبهای مرحلۀ / پایایی با روش بازآزمایی مقدار 78 برنامه ریزی را در عامل انتخاب موضوع، مرحلۀ اجرا را در سه عامل کپی برداری های پژوهشی، عدم توجه به جدول زمان بندی تحقیق و عدم برقراری تعامل صحیح بین دانشجو و استاد راهنما، مرحلۀ تدوین نتایج را به ارتباط دادن نتایج پژوهشی به اهداف و مسئلۀ تحقیق و مرحلۀ دفاع را مربوط به آگاهی نداشتن دانشجویان از معیارهای ارزیابی پایان نامه ها و سلیقه ای بودن این معیارها و شرایط و جو حاکم بر دانشگاه دانسته اند. نتیج هگیری: تمامی عوامل شناسایی شده بر شیوه هدایت پایان نامه ها تأثیرگذارند و عدم رعایت هر مرحله، منجر به بروز مسائلی از قبیل سرقت ادبی و علمی، افت کیفیت پایان نامه ها و افت مقالات مستخرج از پایان نامه ها شده است.
