منابع خوراکهای فصلی در شرایط پرورش گاومیش به صورت خرده مالکی جهت تغذیه دام بسیار مهم هستند. دستکاری میکروارگانیسم های شکمبه، تخمیر و سرانجام جذب را تحت تاثیر قرار می دهد. تحقیقات اخیر نشان می دهد که منابع خوراک در دسترس مثل کاه برنج غنی شده با اوره و کاه گندم و جو اکولوژی شکمبه را بهبود می بخشد و باکتریهای سلولتیک، قارچها و زئوسپورا تخمیر ویژه ای در شکمبه بوجود می آورند. برای بررسی میکروارگانیسم های شکمبه، تفاوتها و نقش آنها در تخمیر و استفاده از مولکوله و محصولات تخمیر با استفاده از تکنیک PCR_DGGE/Real Time-PCR در تحقیقات آینده پیشنهاد می شود