نمونههایی از برگ و سرشاخههای لیموترش، با علائم بیماری شانکر باکتریایی مرکبات در بهار و تابستان 1391، از استان ایلام جمعآوری گردید. باکتری عامل بیماری با روشهای متداول از بافت آلوده جداسازی و براساس ویژگیهای فنوتیپی و طیفسنجی رنگدانه زرد مورد شناسایی ابتدایی قرار گرفت. بیماریزایی جدایهها روی برگهای لیموترش و گریپفورت در شرایط آزمایشگاهی و گلخانهای اثبات گردید. نتایج شناسایی بیماریگر براساس بررسیهای فنوتیپی و ژنوتیپی با کاربرد چهار جفت آغازگر اختصاصی نشان داد که جدایههای مذکور متعلق به زیرگونه Xanthomonas citri subsp. citriمیباشند. نتایج شناسایی اولیه، با توالییابی ژن نیمه حفاظت شده gyrB در نماینده جدایهها تائید گردید. انگشتنگاری ژنتیکی و مقایسه الگوی اثر انگشتی DNA استرینهای جداشده از استان ایلام با سه جدایه تیپ مرجع و نمایندههایی از جدایههای بیماریگر بدستآمده از استانهای کرمان، سیستان و بلوچستان، هرمزگان و فارس نشان دهنده تشابه بین باکتریهای عامل شانکر مرکبات در ایران است.
