بیماری پوسیدگی طوقه و ریشه گندم ناشی از Fusarium culmorum یکی از مهمترین بیماریهای گندم در استان ایلام است. برای تعیین تنوع ژنتیکی بیمارگر در مزارع گندم استان ایلام، تعداد 66 نمونه آلوده از مزارع شهرستانهای مختلف استان جمع-آوری شد. پس از کشت، خالص سازی و شناسایی جدایهها، آزمون مولکولی با استفاده از پنج جفت آغازگر ریز ماهواره انجام گرفت. از آغازگرهای ریز ماهواره 25 آلل در جدایهها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل در هر جایگاه 2/5 مشاهده شد. شاخص چند شکلی نشانگرها در آغازگر F3 با 409/0 بیشترین و در آغازگر F11 با 179/0 کمترین مقدار را دارا بودند. براساس خوشه بندی جدایه ها و با استفاده از الگوریتم الحاق مجاور و ضریب تشابه جاکارد، در سطح تشابه 50 درصد جدایه ها در 18 گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 78 درصد از تنوع ژنتیکی در بین کلیه جدایهها و تنها 22 درصد آن به مناطق مختلف جغرافیایی اختصاص دارد. بنابراین بین جدایهها از مناطق مختلف شباهت ژنتیکی زیادی وجود دارد. شباهت ژنتیکی بالا را میتوان به مهاجرت ژن یا ژنوتیپ در اثر عوامل مختلف نسبت داد.
