شانکر باکتریایی گوجهفرنگی با عامل (Cmm (michiganensis .subsp michiganensis Clavibacter از بیماریهای محدود کننده کشت گوجهفرنگی است. در این پژوهش 16 باکتری اندوفیت جدا شده از ریحان از نظر خاصیت ضد باکتریایی در آزمایشگاه علیه عامل شانکر باکتریایی و تحریک رشد و افزایش فنل کل گیاهچههای گوجه- فرنگی آزمایش شدند. در مرحله بعد بهترین باکتری جهت مهار شانکر باکتریایی روی گیاهچههای گوجهفرنگی در شرایط گلخانه آزمایش گردید. همچنین تغییرات فیزیولوژیکی مرتبط با فنل کل،کاتاالز و پراکسیداز در گیاهچهها مورد بررسی قرار گرفتند. نهایتا شناسایی مولکولی بهترین جدایه باکتری توسط آغازگرهای ژن RNA ریبوزومی S16 صورت گرفت. هیچکدام از باکتریهای اندوفیت خاصیت ضد باکتریایی علیه شانکر باکتریایی در شرایط آزمایشگاه نشان ندا دند، اما جدایه 1ReA بیشترین ویژگیهای تحریک رشد شامل وزنتر و خشک، ارتفاع ساقه و افزایش فنل کل را در مقایسه با سایر باکتریها نشان داد. با فرض اثر احتمالی جدایه 1ReA در مکانیسم القای مقاومت در گوجه فرنگی، این جدایه علیه باکتری Cmm استفاده شد. نتایج نشان داد که این باکتری سبب کاهش پنجاه درصدی بیماری و افزایش فاکتورهای رشدی در گوجه فرنگی می شود. همچنین آنزیم های آنتیاکسیدانی شامل پراکسیداز،کاتاالز و میزان فنل کل در گیاهان تیمار شده با جدایه 1ReA در مقایسه با شاهد افزایش نشان دادند. براساس نتایج حاصل از توالی یابی جدایه 1ReA به عنوان باکتری .sp Enterobacter تشخیص داده شد. ریحان گیاه غیرمیزبان برای Cmm میباشد و باکتریهای اندوفیت ریحان اثر مستقیم ضد باکتریایی علیه Cmm نداشتند. در عین حال .sp Enterobacter جدایه 1ReA قادر به مهار زیستی شانکر باکتریایی گوجهفرنگی با مکانیسم القاء مقاومت بود.
