محمد شمس الهی

پژوهش حاضر با هدف مطالعه پویش کل ژنوم بر اساس آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی برای شناسایی جایگاههای ژنی مؤثر بر صفات رشد با استفاده از آرایههای ژنومی 50K انجام شد. بدین منظور از اطالعات رکوردهای فنوتیپی و ژنوتیپی مرتبط با اوزان تولد )BW ،)شیرگیری )WW،) شش ماهگی )6MW )و دوازده ماهگی )12MW )044 رأس از گوسفند نژاد هوی استفاده شد. ابتدا آنالیز پویش کل ژنومی برای صفات رشد در برنامه TASSEL انجام شد. سپس با استفاده از بسته نرم افزاری biomaRt2 برنامه R ژنهای معنیداری که در داخل و یا 13 کیلوباز باال و پایین دست نشانگرهای معنیدار قرار داشتند، شناسایی شدند. در نهایت تفسیر مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژنهای نزدیک به مناطق انتخابی و ژنهای کاندیدا از طریق پایگاههای GO ،KEGG ،DAVID و PANTHER انجام شد. با تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی، مسیرهای زیستی و )ژنهای کاندیدای( Regulation و IGFBP4( Actin filament polymerization و of skeletal muscle cell proliferation Regulation of anatomical structure ،BW صفت با مرتبط( MYOD1 BMP2) cell junction و regulation of muscle system process ،morphogenesis و Regulation of anatomical structure size ،WW صفت با( MYH10 و THBS1 TGFBR3 ،ANGPTL4 ،FGF2( Regulation of skeletal muscle tissue development Positive ،Anatomical structure morphogenesis و 6MW صفت با( ACTR3 و ،MMP7( Cellular response to growth factor stimulus و regulation of ossification ACTA2 ،EGR1 و MYBPC3 )با صفت 12MW شناسایی شدند. مسیرهای شناسایی شده عملکردهای مهمی را در ارتباط با رشد و توسعه عضالت اسکلتی، متابولیسم گلوکز، فرآیند استخوانسازی، اندازه بدن، ترکیب عضله و تنظیم یون کلسیم بر عهده داشتند. ژنهای کاندیدای گزارش شده در این پژوهش میتوانند درک روشنی از پایه مولکولی مربوط به صفات رشد در گوسفند را ایجاد کنند. نتایج حاصل از این پژوهش میتواند دیدگاه جدیدی در رابطه با معماری ژنتیکی صفات رشد در برنامههای اصالح نژادی گوسفند ایجاد کند