محمد شمس الهی

چکیده زمینه مطالعاتی: امروزه، در اصالح نژاد گاوهای شیرده، روشهای انتخاب مبتنی بر جایگاههای کنترل کننده صفات کمّی و مناطق ژنومی مؤثر بر صفات تولیدی برای افزایش بازده انتخاب و بهبود عملکرد تولیدی مورد توجه قرار گرفته است. هدف: پژوهش حاضر، با هدف مطالعه پویش ژنومی بر اساس آنالیز مجموعههای ژنی برای شناسایی جایگاههای ژنی مؤثر بر صفات تولید و ترکیبات پروتئین شیر در یک جمعیت گاو هلشتاین بوده است. روش کار: برای هر گاو، هشت صفت شامل مقدار و درصد پروتئین و ترکیبات پروتئین آلفا-اس -1کازئین )1αs)، آلفا-اس -2کازئین )CN2-αs)، بتا-کازئین )-β CN)، کاپا-کازئین )CN-κ)، آلفا-الکتوآلبومین )LA-α )و بتا-الکتوگلوبولین )LG-β )رکورد جمعآوری شده بود. در این تحقیق، ابتدا،ً آنالیز پویش کل ژنومی در برنامه PLINK انجام شد. سپس، با استفاده از بسته نرم افزاری 2biomaRt تحت برنامه R ژنهای معنیداری که در داخل و یا 15 کیلوباز باال و پایین دست نشانگرهای معنیدار قرار داشتند، شناسایی گردید. در نهایت، آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی با برنامه KOBAS با هدف شناسایی عملکرد بیولوژیکی ژنهای نزدیک به مناطق انتخابی و ژنهای کاندیدا از طریق پایگاههای برخط GO، KEGG، Reactome، BioCyc و PANTHER انجام شد. نتایج: تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی تعداد 20 طبقات هستیشناسی و مسیرهای بیوشیمیایی با صفات مورد Response to ،Glycerolipid metabolism ،Oxytocin signaling pathwayطبقات بین این از .(P˂0/05( شد شناسایی بررسی ژنهای داشتن با amino acid binding و Complement and coagulation cascades ،Detection of calcium ion ،progesterone حجم و تولید در یّمهم نقش PAEP و ODC1 ،SLC35A3 ،SERPINA1 ،CSN2 ،CSN1S1 ،SPP1،P4HTM ،CDH13 کاندیدای پروتئین، فسفریله کردن گلیکوپروتئینها، استحکام انعقاد شیر و سنتز الکتوز داشتند. نتیجه گیری نهایی: بعنوان جمعبندی، یافتههای این تحقیق نشان داد پتانسیل انتخاب ژنتیکی برای بهبود کیفیت شیر از جمله ترکیبات پروتئینی شیر امکان پذیر میباشد، بطورئیکه بهبود حاصل از انتخاب ژنتیکی به دلیل توارثپذیری، تجمعی و دائمی بودن بسیار مفید است.