امروزه وجود بقایای آنتی بیوتیکی در فرآورده های غذایی با منشأ دامی و احتمال انتقال آن به انسان، نگرانی های زیادی را برای مصرف کنندگان ایجاد کرده است. از مهم ترین خطر باقیمانده های آنتی بیوتیکی در مواد غذایی می توان به بروز مقاومت دارویی در برابر باکتری های پاتوژن، واکنشهای آلرژیک، مسمومیت، سرطانزایی و اثر سوء بر فلور میکروبی روده اشاره کرد. از این رو استفاده از تکنیک های مناسب جهت اندازه گیری این ترکیبات در مواد غذایی اهمیت بالایی دارد. در این پژوهش راههای تشخیص و جداسازی آنتی بیوتیک ها شامل روشهای میکروبی، ایمونوشیمیایی وفیزیکوشیمیایی و همچنین شناسایی بهترین روش مورد بررسی قرار گرفته است. اگرچه هرکدام از این روش ها محاسن و معایب خاص خود را دارد اما مطالعات نشان می دهد که روش کروماتوگرافی از نوع HPLC برخلاف طولانی بودن زمان اجرایی آن به دلیل شناسایی دقیق و کمیت یابی آنتی بیوتیک ها و همچنین به دلیل حساسیت بالا و سازگاری آن برای اندازه گیری ها و مناسب بودن آن برای گونه های ناپایدار بهترین روش به شمار می آید.